För forskare

2. Kliniska data

• Visits and wards (since 1976, more broadly 2004-)
  • Location, specialty, mode of admittance, start and end dates
  • Patient origin and transfer location
  • ICD10 diagnoses
• Diagnoses (since 1976, more broadly 2004-)
  • ICD format
• Pathology (since 1985)
  • Anamnesis and statements by pathologists
  • Snomed M and T classifications
  • Pathology diagnoses
  • Pathology tables
• Procedures (since 1994)
  • Operations
  • Small procedures
  • Radiology procedures
• Radiology (since 1996)
  • Anamnesis and statements by radiologist
  • Scan details
• Radiation therapy (since 1997)
  • Fractions
  • Total dose
• Medical texts (patient narratives) (since 2004)
• Demographics (since 2004)
  • Sex, date of birth, date of death
• Laboratory tests
  • Results (numerical) and patient specific reference ranges (since 2005)
  • Statements (since 2014)
• Spirometry (since 2006)
• Treatment tables (since 2006)
  • E.g. height, weight, blood pressure
• Medications
  • Medications prescribed during in-patient treatment periods (since 2010)
  • Cancer medications (since 2004)
  • Prescriptions (for out-patient use) (since 2010)

3. EDTA-blodprover

Målet är en 10 ml EDTA-blodprov ska tas av alla som gett sitt samtycke till Auria Biobank. Proven centrifugeras och därefter delas plasman i två partier på 475 µl och helblodet* i två partier på 450 µl. Proverna förvaras vid -80 °C.

*EDTA-blodproven centrifugeras, varefter plasma mäts upp från den med pipett. Därefter rörs provröret om innan helblod mäts upp med pipett. Plasmahalten i dessa helblodprover är lägre än i den ursprungliga proven. Proverna ger högre utbyte vid DNA isolering än den ursprungliga proven.

4. DNA-prover

DNA isoleras från en del av helblodprover som har samlats på grund av biobank samtycke. I detta fall isoleras DNA från färska prover och DNA-innehållet i proverna mängdbestäms. DNA kan också isoleras från djupfrysta prover. Proverna förvaras vid -80 °C.

5. Serumprover (PSA)

Auria Biobank har tagit över den urologiska poliklinikens provsamling, som omfattar diagnostiska serumprover av män som lämnat PSA-prover på ÅUCS åren 1996 och 1997. Samlingen består av totalt cirka 7 000 serumprover. Proverna är uppdelade i partier på 450 µl och lämnas ut till medicinsk forskning på ansökan. Proverna förvaras vid -80 °C.

6. Serumprover

Sedan 2019 har Auria Biobank samlat in ett överskott av diagnostiska serumprover. Proverna har förvarats tillfälligt vid -20 °C och har avfrostats en gång. Proverna delas in i 400-450 µl alikvoter och förvaras vid -80 ° C.

7. Cerebrospinalvätskaprover

Sedan 2020 har Auria Biobank samlat in ett överskott av diagnostiska cerebrospinalvätskaprover. En del av prover är frysta färska vid -80 °C men några har förvarats tillfälligt vid -20 °C och har avfrostats en gång. Proverna centrifugeras, delas in i 300-600 µl alikvoter och förvaras vid -80 °C.

8. Endomet- Proendo-kohorter

Endomet-Proendo-studien (ÅUS och Åbo universitet) fokuserar på att utveckla nya sätt för: identifiering av endometrios, bedömning av behandlingseffekten och sjukdomsåterfall samt patientövervakning. Serumprover samlades in för studien från mer än 300 deltagare mellan 2005 och 2015. Andra provtyper finns också tillgängliga, till exempel urin.

9. Serum- och plasmaprover från äggstockscancer

Sedan 2009 har det till biobanken överförts serum- och plasmaprover av patienter med äggstockscancer, som behandlats på ÅUS samt tillhörande klinisk data . Longitudinella serier har insamlats från proven, t.ex. före behandling — under behandling — efter behandling. Proverna lagras i -80°C. Insamlingen pågår fortfarande.

10. Urinprover

Sedan 2023 har Auria samlat in ett överskott av diagnostiska urinprover. Proverna har förvarats tillfälligt vid +4 °C. Proverna delas in i 900 µl alikvoter och förvaras vid -80 ° C.

11. Organoids

Organoid cultures from patient-derived tumors of high-grade serous ovarian cancer. Stable and well-characterized with clinical data.